将微生物菌剂添加在叶面肥中的作用有：为农作物提供能够被直接吸收的养分，避免养分在土壤中固定与退化；提高农作物的抗逆能力以及光合效率；促进作物的根系的发育，防止植株徒长等。

使用微生物菌剂能在一定程度上让烟叶变黄（烘烤后增加外观质量）。对烟草施用微生物菌剂不但能提高烟株的抗病能力，还能缩短植株上部的烟叶的成熟所需时间，同时还能让烟叶变得容易烘烤。

喷施方法：将微生物菌剂稀释成150-300倍液，然后均匀地喷施在农作物的叶面上和叶柄上即可，喷施的时候可以根据农作物的长势和生长期来调整稀释的倍数。灌根方法：将其稀释成150-300倍液后直接浇施农作物的根部即可，施用量以浸湿土壤为宜。

使用微生物菌剂对农作物进行叶面喷施和灌根一般不会导致烧苗，但前提是要将其稀释成合适的浓度。微生物菌剂是指目标微生物（比如有效菌）经过工业化生产和扩繁等流程后，再利用多孔物质作为吸附剂（比如草炭和蛭石）来吸附菌体产生的发酵液，最后将它加工而得到的一种活菌制剂。

微生物菌剂发白（长出白色的菌丝）有可能是因为包装袋内进入了空气，使得其中的活性菌开始大量繁殖，从而出现了“发白”的现象。使用时的注意事项：开袋后要尽快使用，以免其它细菌进入袋中影响到菌剂的使用效果；避免在高温条件下使用，高温天气会影响到活性菌的繁殖，使其肥效无法被完全发挥出来。

农用微生物菌剂和有机物料腐熟剂的保质期均为6个月，而液体剂型的微生物菌剂的保质期一般为≥3个月。微生物菌剂按剂型来分类一般可以分为液体、粉剂和颗粒型；按含有的微生物的种类（或功能特性）可以分为根瘤菌菌剂、固氮菌菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐微生物菌剂、光合细菌菌剂、有机物料腐熟剂以及促生菌剂等。

微生物菌剂过期之后一般还可以使用，但是它的有效菌的活性会大大降低，因此肥效也会有明显的下降。购买的微生物菌剂建议在当年施用，因为包装袋一旦被开封，活性菌就会开始加快繁殖的速度，并且开袋的时间越久，其挥发量也越高，因此为了避免肥效的流失，开袋后应要尽快用完。

微生物菌剂可以在苗期使用。使用方法：将微生物菌剂与麦麸、磨碎的稻糠、豆粕或少量的玉米粉、黄豆粉等有机质混匀，然后在土壤中挖出一个深度适宜的土穴，再将其施入其中并覆盖上土壤即可。

微生物菌剂不可以和草木灰一起用。微生物菌剂中含有较多活菌，而草木灰呈碱性，混合使用容易杀死大多数菌种，微生物菌剂对环境要求较严格，除了不能和草木灰混用外，也不能和杀菌剂、含硫的肥料、杀虫剂等混用。

微生物菌剂有粉剂型，也有颗粒型，还有液体型。微生物菌剂是经过工业化生产扩繁后，利用多孔的物质作为吸附剂，吸附菌体的发酵液加工制成的活菌制剂，也是一种辅助肥料，在使用时可以与有机肥一起使用，能提高肥料吸收利用率，提高农产品产量。

微生物菌剂粉剂可以作底肥、追肥使用，可直接撒入土中，覆一层土，并及时浇水，作底肥使用时每亩可用4千克左右，作追肥使用每亩可用1-2千克。除了作底肥和追肥外，微生物菌剂还可以用来拌种、浸种、蘸根等。

营养元素不同：复合肥的养分以氮、磷、钾为主，总养分为25-60%，肥效期稳而长，可作基肥使用，尿素的养分以氮元素为主，肥效期短，可作为追肥使用。

含氮量不同：复合肥的含氮量不固定，低浓度含量为25-30%，中浓度含量为30-40%，高浓度含量为40%以上，尿素的含氮量为46%，是目前固体氮肥含氮量最高的一种。