宁南霉素不能与呈碱性的农药混合使用。宁南霉素可有效防治烟草、番茄、辣椒、瓜类、果树、豆类等多种作物的病毒病,并可防治白粉病、根腐病、茎腐病、立枯病、疫病、等真菌性病害以及水稻白叶枯病、白菜软腐病、茄科作物青枯病等细菌性病害,还可以防治香蕉束顶病、花叶心腐病、人参立枯病和茎腐病等病害。
宁南霉素可以和氟菌唑、拿敌稳、多抗霉素等药物混用。宁南霉素是一种抗菌素类杀菌剂,它在酸性环境下较稳定,在碱性环境下容易分解并失去药性。在使用该药物的过程中,一般不与波尔多液、络氨铜等碱性药物混合使用。