裸藻水华形成中期影响鱼虾摄食;裸藻大量繁殖迅速铺盖整个水面,封闭水体,影响空气的溶入,致使水下溶解氧很低、生态系统面临崩溃、致病细菌大量繁殖、鱼虾体质极度虚弱,导致鱼虾患病;裸藻大量死亡后,其藻类尸体迅速被分解,不但败坏水质,而且分泌的物质对鱼类有毒害作用。
水域水体营养化会造成水藻在水体大量生长,可以利用裸藻早清晚绿的特性进行人工捕捞,在养殖水产期间更换新鲜的活水可以使用对角防水的方式,减少裸藻数量,裸藻对于ph值较敏感,在水中加入硫酸亚铁溶液,降低水体ph值,抑制裸藻生长,裸藻喜爱在温暖的环境中,有条件可以在池塘搭建遮阳棚,保证水体阴凉。